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医学院汪业军老师课题组在《Environmental Microbiology》发表论文

文章来源:基础医学院 作者: 发布时间:2017年05月11日 点击数: 字体:

深圳大学医学部基础医学院汪业军老师课题组在微生物、环境和生态领域顶级期刊《Environmental Microbiology》发表研究论文,标题为“A global survey of bacterial type III secretion systems and their effectors”(http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/1462-2920.13755/abstract)。深圳大学医学部胡跃明和北京协和医学院黄鹤博士为并列第一作者,深圳大学医学部临床本科生程希为第三作者,汪业军老师为通讯作者,深圳大学为第一单位和第一通讯单位。本项目由国家自然科学基金及深圳市基础研究基金共同资助。

细菌致病性至今仍是人体健康的重要威胁,同时也严重影响着畜牧业和农业。大量细菌通过一种被称作“III型分泌系统”的针管样突起将致病蛋白导入宿主细胞内从而引起各种疾病,如鼠疫、伤寒、痢疾、霍乱、沙眼、水稻白叶枯、条班病等。已经明确III型分泌系统和细菌-宿主相互作用及致病性关系密切,究竟有多少未知细菌具有这一系统、从而可能是潜在的致病原?这些致病系统是如何进化的?有多少潜在的经III型分泌系统转运的致病性蛋白?这些蛋白分泌系统的基因表达是如何调控的?

为阐释上述问题,课题组通过收集和注释已知的III型分泌系统基因,通过比较分析,首次发现III型分泌系统基因的微共线性规律,利用这种规律并结合生物信息学分析,从GenBank存储的所有细菌基因组中鉴定了174个进化来源不同的III型分泌系统,分布于5个不同的门和109个属,聚集成13个不同的类别。大量的细菌都属于环境细菌,未有与真核宿主作用或者致病性的报道。进一步的信息分析在这些细菌中鉴定了8,740个高度可能的致病蛋白。这些III型分泌系统基因的表达调控因子和网络呈现低水平的高度保守和高水平的分化。课题组还开发了数据库,对这些致病系统和基因进行注释:http://www.szu-bioinf.org/T3Enc。该研究是迄今最全面、系统的细菌III型分泌系统及其致病效应蛋白和调控网络的分析研究,首次系统揭示了该致病系统的广泛变异性和超预期分布,为更好地理解细菌致病机理及进化奠定基础。

《Environmental Microbiology》是环境科学和生态学以及微生物学领域的国际TOP期刊,影响因子为5.93,中科院分区(环境科学与生态学)1区期刊。

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