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副教授

刘雪

来源: 发布时间:2021-10-20 16:08:59 浏览次数: 【字体:

副教授,硕士生导师

邮箱:xueliu@szu.edu.cn

 

  华中科技大学学士,清华大学医学院博士,荷兰格罗宁根大学联合培养博士,瑞士洛桑大学博士后。2021年8月入职深圳大学医学部,组建人类病原性细菌研究团队,研究方向为重要人类病原性细菌的致病机理和非模式菌的基因编辑工具开发。近年发表SCI论文15篇,其中第一作者(含共同一作)论文8篇,包括多篇领域内的高水平期刊,如Cell Host & Microbe, Molecular Cell, Nature Protocols, Nature Structural & Molecular Biology, Molecular Systems Biology (封面文章)等。课题组感兴趣的病原菌包括肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯菌和铜绿假单胞菌;采用的主要技术手段为CRISPRi 阵列库,以及CRISPRi和二代测序结合的CRISPRi-seq。目前聚焦在利用CRISPRi-seq进行高通量的必需基因功能和毒力因子鉴定,抗菌化合物抗菌机理研究,筛选病原菌治疗靶点。

  课题组擅长基于CRISPR/Cas9系统的工具开发,另一重要研究方向为在非模式细菌中开发基因编辑工具。


 

研究方向:

重要人类病原菌的致病机理、抗菌化合物的抗菌机理、病原菌治疗靶点筛选及功能鉴定;

非模式菌的基因编辑工具开发。


主持项目:

(1) 国家自然科学基金委面上项目 “磷壁酸在肺炎链球菌感染中的作用及机制研究”,2023-01-01 至 2026-12-31,53万,主持。

(2) 深圳大学 医学学科建设-人才启动,主持。

(3) 深圳大学青年教师科研启动经费 “利用CRISPRi-seq研究重要病原菌的致病机理”,10万,主持。

(4) 深圳大学-未知君生物科技有限公司技术开发,横向,40万,主持。

 

代表性成果:

1. Liu Xue *, Kimmey, J.M. *, Matarazzo, L. *, de Bakker, V., Van Maele, L., Sirard, J.-C., Nizet, V., and Veening, J.-W. (2021). Exploration of Bacterial Bottlenecks and Streptococcus pneumoniae Pathogenesis by CRISPRi-Seq. Cell Host & Microbe. Volume 29, Issue 1, 13 January 2021, Pages 107-120.e6.

 

2. Liu Xue, Gallay, C., Kjos, M., Domenech, A., Slager, J., van Kessel, S.P., Knoops, K., Sorg, R.A., Zhang, J.R., and Veening, J.W. (2017). High-throughput CRISPRi Phenotyping Identifies New Essential Genes in Streptococcus pneumoniae. Molecular systems biology 13, 931. (Cover paper)

 

3. Liu Xue, Li, J.W., Feng, Z., Luo, Y., Veening, J.W., and Zhang, J.R. (2017). Transcriptional Repressor PtvR Regulates Phenotypic Tolerance to Vancomycin in Streptococcus pneumoniae. Journal of bacteriology 199.


4. Zhang, B. *, Liu Xue *, Lambert, E. *, Mas, G., Hiller, S., Veening, J.-W., and Perez, C. (2020). Structure of a proton-dependent lipid transporter involved in lipoteichoic acids biosynthesis. Nat Struct Mol Biol 27, 561–569.


5. Vincent, B. *, Liu, Xue*, Afonso, B. Jan-Willem, V. (2021) CRISPRi-seq: Genome-wide fitness quantification in bacteria using dCas9 and pooled sgRNA sequencing. Nat Protoc 17, 252–281. 10.1038/s41596-021-00639-6.

 

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