广东省中药有效成分与肠道微生物组学重点实验室于2024年获批建设，实验室旨在研究肠道菌群演化与重大及慢性疾病的因果关联，挖掘疾病发生、进展、治疗响应与肠道微生态重塑的内在科学规律与生物学基础；人工智能赋能数字化呈现中药调节肠道微生态的全景式景观，破解传统中医药预防和治疗疾病的科学内涵，为国粹中医药做好现代科学注释。

实验室现有固定人员41人；其中研究人员36人、实验技术人员5人；具有博士学位者36人、具有硕士学位者5人。研究人员中，教授5人（国家杰出青年科学基金获得者1人、千人计划1人、海外杰青1人、国家科技部重大专项首席1人，国家自然科学基金二审专家2人）、研究员1人、副研究员6人、副教授4人、助理教授6人、助理研究员11人。本实验室重点开展基于肠道菌群的中药创新研究，设置三个相互关联的研究方向：肠道微生物与疾病相关性解析；中药化学成分全景式解析；肠道微生态介导的中药干预重大疾病的机制解析。

本实验室建设目标为：打造基于肠道菌群的中药创新研究国际化科学中心；建设国际一流人才培养基地和科研平台；争取实现前瞻性基础研究、引领性原创成果的重大突破；促进中药与微生物组学研究领域的学科交叉创新；推动基础研究、应用基础研究、技术创新的融通发展，争取5年左右建设成为省部共建或国家重点实验室，也争取以此“重点实验室”为依托新增国家级工程中心等平台。